Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RBBP4Q09028 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms