Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARF5P84085 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ARF5P84085 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF5P84085 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms