Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPAP53621 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPAP53621 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COPAP53621 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COPAP53621 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms