Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CXCL3P19876 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms