Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD8P13378 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms