Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBOX1O75936 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms