Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms