Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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UBXN8O00124 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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UBXN8O00124 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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UBXN8O00124 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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UBXN8O00124 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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UBXN8O00124 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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UBXN8O00124 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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