Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QRK9 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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J3QRK9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QRK9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QRK9 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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