Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK3Q9UBP4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK3Q9UBP4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms