Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SHANK2-AS3Q9BTD1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms