Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C2orf88Q9BSF0 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms