Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CNN2Q99439 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms