Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLMNQ96JQ2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLMNQ96JQ2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms