Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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LINC00526Q96FQ7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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LINC00526Q96FQ7 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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LINC00526Q96FQ7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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