Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SRSF12Q8WXF0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms