Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDCL2Q8N4E4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms