Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HRCT1Q6UXD1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms