Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms