Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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