Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms