Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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