Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TWIST1Q15672 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms