Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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