Protein–RNA interactions for Protein: Q14669

TRIP12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP12Q14669 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIP12Q14669 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms