Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPIDRQ14159 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SPIDRQ14159 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SPIDRQ14159 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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SPIDRQ14159 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SPIDRQ14159 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPIDRQ14159 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SPIDRQ14159 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SPIDRQ14159 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SPIDRQ14159 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SPIDRQ14159 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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