Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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