Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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