Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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ITGB3BPQ13352 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGB3BPQ13352 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGB3BPQ13352 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGB3BPQ13352 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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ITGB3BPQ13352 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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ITGB3BPQ13352 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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