Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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