Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP1B1Q10567 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms