Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FPGSQ05932 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms