Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HBBP68871 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms