Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ERVFRD-1P60508 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms