Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GYS2P54840 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms