Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA4P35212 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GJA4P35212 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GJA4P35212 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GJA4P35212 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms