Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB4P28070 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB4P28070 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms