Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XPAP23025 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XPAP23025 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms