Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms