Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ZBED1O96006 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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