Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SLC25A20O43772 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms