Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FANCAO15360 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FANCAO15360 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FANCAO15360 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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