Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VWA8A3KMH1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms