Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms