Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNMT3BQ9UBC3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms