Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL42Q9P2K6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms