Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRA1Q9HD15 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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