Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NICN1Q9BSH3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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