Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3GL3Q99963 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SH3GL3Q99963 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SH3GL3Q99963 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3GL3Q99963 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SH3GL3Q99963 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3GL3Q99963 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3GL3Q99963 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SH3GL3Q99963 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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