Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms